156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2163 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  417  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  49.76 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  52.61 
 
 		 219 aa  198  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  49.53 
 
 		 215 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  48.6 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  48.13 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  51.89 
 
 		 220 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  49.03 
 
 		 218 aa  194  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  47.85 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  53.3 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  50 
 
 		 232 aa  191  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  48.54 
 
 		 218 aa  191  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  45.24 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  47.62 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  48.33 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  49.31 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  49.53 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  50.47 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  50.47 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  49.06 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  47.71 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  48.58 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  43.93 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  54.07 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  45.37 
 
 		 215 aa  161  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  44.98 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  46.41 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  53.11 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  43.98 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  46.77 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  45.83 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  51.3 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  45.31 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  48.7 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  45.31 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  41.88 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  38.71 
 
 		 218 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  36.53 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  36.94 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  39.52 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  38.32 
 
 		 218 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  37.8 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  37.72 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  43.41 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  36.25 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  43.41 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  34.52 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  42.64 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  33.33 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  31.87 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  31.98 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  35.87 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  28 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  27.55 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  30.38 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  49.09 
 
 		 338 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  29.45 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  28.36 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  30.92 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  26.12 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  31.17 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  30.97 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  60 
 
 		 321 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  29.66 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  28.35 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  32.52 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 249 aa  51.6  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  44.74 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  26.8 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  32.41 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  27.08 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  50 
 
 		 298 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  27.08 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  60.42 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  29.33 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  30.19 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  27.08 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  33.65 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1671  RNA methyltransferase related protein  31.48 
 
 		 295 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  27.08 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.96 
 
 		 306 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.78 
 
 		 313 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  31.71 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.71 
 
 		 315 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.47 
 
 		 299 aa  49.3  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02680  nicotinamide N-methyltransferase, putative  26.03 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.58 
 
 		 308 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.58 
 
 		 308 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  23.88 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.63 
 
 		 313 aa  48.5  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  47.37 
 
 		 296 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 		 312 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.15 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  29.55 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.37 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.29 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.64 
 
 		 304 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  25.64 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0229  RNA methyltransferase related protein  30.19 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>