179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0515 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 235 aa  480  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  60.71 
 
 		 233 aa  289  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  61.29 
 
 		 231 aa  271  8.000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  58.82 
 
 		 236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  58.22 
 
 		 235 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  57.21 
 
 		 239 aa  260  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  55.11 
 
 		 229 aa  254  6e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  41.58 
 
 		 200 aa  128  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  31.35 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  33.77 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  32.2 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  31.63 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  34.38 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  41.3 
 
 		 249 aa  101  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  30.32 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 218 aa  92  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  25.82 
 
 		 244 aa  88.6  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  32.35 
 
 		 264 aa  88.6  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  27.32 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  28.28 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  39.19 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  39.19 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  36.64 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  28.46 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  34.36 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  36.18 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  32.47 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  30.77 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  26.26 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  35.11 
 
 		 216 aa  62  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  32.31 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  28.67 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  23.32 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  37.13 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  33.08 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  31.54 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  26.78 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  33.59 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  28 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  22.86 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  22.86 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  22.86 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  39.55 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  22.86 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  31.54 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  34.29 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  30.86 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  31.95 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  35.93 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  32.2 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  25.76 
 
 		 524 aa  54.7  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  31.91 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  33.71 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92228  predicted protein  29.1 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  31.94 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  23.86 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  28.05 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40967  predicted protein  25.68 
 
 		 458 aa  52.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  24.05 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46702  predicted protein  37.84 
 
 		 337 aa  52.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.761256  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  41.1 
 
 		 338 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36186  predicted protein  26.29 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  32.8 
 
 		 288 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.83 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.81 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02124  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.6 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369264  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1825  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.7 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1501  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.7 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  28.46 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  33.75 
 
 		 294 aa  49.3  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.96 
 
 		 232 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.77 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.77 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.77 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  26.06 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.77 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.77 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  33.08 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.55 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  27.72 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  32.88 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1435  ribosomal L11 methyltransferase  34.48 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.97 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.17 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.97 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 270 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.29 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.83 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.97 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.97 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>