257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1927 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  427  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  93.46 
 
 		 220 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  92.59 
 
 		 216 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  71.89 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  73.71 
 
 		 232 aa  285  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  72.17 
 
 		 216 aa  278  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  64.62 
 
 		 217 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  61.86 
 
 		 215 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  67.74 
 
 		 219 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  61.32 
 
 		 218 aa  255  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  62.5 
 
 		 218 aa  254  9e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  62.02 
 
 		 218 aa  251  7e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  61.29 
 
 		 232 aa  248  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  60.58 
 
 		 218 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  59.43 
 
 		 219 aa  241  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  59.35 
 
 		 220 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  57.55 
 
 		 223 aa  238  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  60.56 
 
 		 219 aa  235  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  58.94 
 
 		 223 aa  235  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  60.47 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  60.47 
 
 		 231 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  58.96 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  51.64 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  49.32 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  48.86 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  50 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  47.71 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  51.67 
 
 		 222 aa  161  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  49.07 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  47.22 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  51.92 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  48.83 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  48.98 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  45.32 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  43.35 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  47.96 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  41.94 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  41.01 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  39.35 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  46.09 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  43.17 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  43.17 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  38.02 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  44.68 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  43.26 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  40.65 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  34.31 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  41.56 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  34.27 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  32.31 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  41.38 
 
 		 338 aa  58.5  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  53.85 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.73 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.1 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  32.76 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.21 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.85 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0608  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.38 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217984  hitchhiker  0.0000000198415 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.85 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.85 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.85 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  29.93 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  47.76 
 
 		 578 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  30.08 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  27.83 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  36.73 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  44.44 
 
 		 299 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.15 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.45 
 
 		 293 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.15 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.15 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.15 
 
 		 306 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  35.92 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  30.08 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.15 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  28.79 
 
 		 246 aa  52.4  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  46.67 
 
 		 318 aa  52.4  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  38.78 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.67 
 
 		 316 aa  52  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.17 
 
 		 293 aa  52  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.3 
 
 		 293 aa  51.6  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.34 
 
 		 289 aa  51.6  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2003  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.67 
 
 		 293 aa  51.6  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.221022  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02290  arginine N-methyltransferase 3, putative  40.58 
 
 		 596 aa  51.2  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.17 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.04 
 
 		 315 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  32.84 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.3 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.7 
 
 		 289 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.97 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  26.87 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  30.95 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0391  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.28 
 
 		 293 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000998179  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 		 293 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.62 
 
 		 305 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  30.95 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>