201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3352 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  100 
 
 		 226 aa  430  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  92.48 
 
 		 226 aa  357  6e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  47.76 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  46.67 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  45.54 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  44.62 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  44.04 
 
 		 218 aa  164  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  44.81 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  45.64 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  43.52 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  43.78 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  43.01 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  42.56 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  44.04 
 
 		 216 aa  158  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  44.72 
 
 		 220 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  44.81 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  46.04 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  44.29 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  53.27 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  45.41 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  43.56 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  42.71 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  44.9 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  44.62 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  43.78 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  51.26 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  43.35 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  43.52 
 
 		 217 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  47.67 
 
 		 214 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  49.18 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  41.44 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  44.39 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  44.1 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  42.86 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  43.81 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  48.91 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  39.74 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  38.85 
 
 		 218 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  39.07 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  47.06 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  43.7 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  43.7 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  44.09 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  37.86 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  44.88 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  44.09 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  43.42 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  35.07 
 
 		 216 aa  62  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  29.85 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  31.16 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  37.61 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  35.96 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  27.41 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  32.58 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  28.36 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  28.36 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  28.36 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  28.36 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  32.74 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  27.61 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  27.08 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  27.41 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  35.92 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  36.79 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  29.5 
 
 		 300 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0608  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  48.39 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217984  hitchhiker  0.0000000198415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  33.88 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  50.48 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  44.59 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.29 
 
 		 300 aa  51.6  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 304 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  36.21 
 
 		 292 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  31.36 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.72 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  34.38 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  26.12 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  56.52 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  38.24 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  28.86 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  36.51 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  28.46 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  27.94 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  36.76 
 
 		 264 aa  48.9  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  36.76 
 
 		 264 aa  48.5  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 		 295 aa  48.9  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45331  predicted protein  40.85 
 
 		 340 aa  48.5  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0689578  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.3 
 
 		 294 aa  48.5  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.77 
 
 		 321 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  42.17 
 
 		 578 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  27.93 
 
 		 129 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1943  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  48.89 
 
 		 299 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  26.55 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  34.38 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.55 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.37 
 
 		 306 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.16 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41615  predicted protein  34.09 
 
 		 386 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>