248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0759 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  71.03 
 
 		 216 aa  288  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  74.06 
 
 		 232 aa  288  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  71.89 
 
 		 216 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  74.06 
 
 		 216 aa  284  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  73.02 
 
 		 220 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  66.21 
 
 		 219 aa  264  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  61.79 
 
 		 215 aa  262  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  61.32 
 
 		 217 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  62.33 
 
 		 232 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  58.74 
 
 		 218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  60.68 
 
 		 218 aa  252  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  58.25 
 
 		 218 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  57.55 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  61.72 
 
 		 223 aa  244  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  61.11 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  64.95 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  56.07 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  55.87 
 
 		 223 aa  233  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  58.49 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  61.4 
 
 		 225 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  55.61 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  50.46 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  47.25 
 
 		 221 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  47.25 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  56.19 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  51.87 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  49.53 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  55.24 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  47.71 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  47 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  48.13 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  51.53 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  48.02 
 
 		 226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  51.05 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  44.81 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  43.88 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  42.58 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  40.65 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  46.76 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  46.72 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  47.33 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  45.32 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  44.52 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  43.87 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  45.99 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  31.95 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  35.51 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.53 
 
 		 296 aa  62  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  51.39 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  28.57 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.74 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  31.87 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  31.33 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  40.91 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  32.04 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  33.98 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  28.15 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.48 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.95 
 
 		 308 aa  55.1  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.95 
 
 		 308 aa  55.1  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  40.96 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  35.56 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  34.15 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  34.58 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.08 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  33.59 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.18 
 
 		 299 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.38 
 
 		 313 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  44.44 
 
 		 578 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.35 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.84 
 
 		 307 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.83 
 
 		 292 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.04 
 
 		 312 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  45.45 
 
 		 311 aa  53.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  56.52 
 
 		 299 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.61 
 
 		 306 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.03 
 
 		 293 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.94 
 
 		 295 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.23 
 
 		 313 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.94 
 
 		 293 aa  52  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  35.45 
 
 		 414 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36300  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  48.05 
 
 		 394 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.06 
 
 		 305 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.92 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  34.38 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.94 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2244  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.71 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.924831  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.82 
 
 		 295 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15961  predicted protein  42.11 
 
 		 1080 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.7 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.7 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.65 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.65 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>