289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3618 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  100 
 
 
218 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  47.25 
 
 
219 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  47.22 
 
 
219 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  43.52 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  43.52 
 
 
217 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  46.26 
 
 
219 aa  170  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  43.72 
 
 
218 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  46.76 
 
 
218 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  47.2 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  47.2 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  46.48 
 
 
219 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  35.68 
 
 
223 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  43.38 
 
 
218 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  36.47 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  37.44 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  42.65 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  39.72 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  41.3 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  36.47 
 
 
218 aa  95.9  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  42.11 
 
 
223 aa  91.7  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  39.44 
 
 
232 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  36.94 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  37.58 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  33.73 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  40.43 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  40 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  39.72 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  36.02 
 
 
232 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  43.01 
 
 
225 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  38.3 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  40 
 
 
219 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  40.15 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  38.46 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  34.97 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  43.31 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  35.35 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  38.41 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  36.17 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  36.17 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  50.48 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  38.94 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  37.86 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.69 
 
 
300 aa  62  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  35.98 
 
 
215 aa  61.6  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  37.29 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  38.36 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  39.39 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  43.56 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  50.48 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  37.04 
 
 
249 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  35 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.61 
 
 
295 aa  55.5  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.28 
 
 
304 aa  55.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.3 
 
 
298 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.17 
 
 
297 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  33.96 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  52 
 
 
293 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.3 
 
 
298 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.86 
 
 
304 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
295 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  25.95 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
295 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.3 
 
 
302 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  37.65 
 
 
258 aa  52.8  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  33.33 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  32.89 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 
295 aa  52.4  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.53 
 
 
300 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.53 
 
 
300 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.53 
 
 
300 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  34.51 
 
 
231 aa  52.4  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.53 
 
 
300 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.53 
 
 
300 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
293 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.53 
 
 
300 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.08 
 
 
306 aa  52  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.08 
 
 
293 aa  52  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.08 
 
 
293 aa  52  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  52 
 
 
293 aa  52  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  53.19 
 
 
293 aa  51.6  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  44.44 
 
 
214 aa  51.6  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.89 
 
 
316 aa  51.6  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
295 aa  51.6  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.91 
 
 
298 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.4 
 
 
315 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
293 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.08 
 
 
295 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.35 
 
 
294 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.34 
 
 
304 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
295 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  32.46 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0391  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
293 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000998179  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  35.62 
 
 
338 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  33.98 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.06 
 
 
321 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  48 
 
 
293 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.11 
 
 
312 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.1 
 
 
300 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.1 
 
 
300 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>