182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5047 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  87.26 
 
 		 216 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  74.06 
 
 		 219 aa  289  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  73.36 
 
 		 220 aa  286  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  73.71 
 
 		 216 aa  286  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  72.81 
 
 		 216 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  71.56 
 
 		 219 aa  280  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  63.64 
 
 		 218 aa  278  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  63.64 
 
 		 218 aa  276  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  63.18 
 
 		 218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  63.85 
 
 		 215 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  62.74 
 
 		 217 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  60.85 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  60.27 
 
 		 232 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  58.88 
 
 		 219 aa  248  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  59.17 
 
 		 220 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  55.91 
 
 		 223 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  57.28 
 
 		 219 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  59.35 
 
 		 218 aa  231  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  60.17 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  61.64 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  56.28 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  57.21 
 
 		 223 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  55.35 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  50.23 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  51.18 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  51.18 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  50.47 
 
 		 214 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  51.67 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  47.83 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  52.63 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  51.22 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  52.15 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  47.51 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  44.83 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  43.78 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  41.01 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  41.98 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  45.8 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  36.52 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  44.62 
 
 		 219 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  43.51 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  47.33 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  45.04 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  42.75 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  50.44 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  32.74 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  43.88 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  35.51 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  34.95 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  40.91 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.24 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  31.07 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  28.24 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  32.35 
 
 		 338 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  32.81 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  38 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.84 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.3 
 
 		 316 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  32.41 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  32.06 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  29.41 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.37 
 
 		 300 aa  52  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  28.47 
 
 		 300 aa  52  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  30.6 
 
 		 264 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.84 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  42.62 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  26.57 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.03 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  47.37 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  46.48 
 
 		 578 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  41.67 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  25 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.17 
 
 		 315 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02290  arginine N-methyltransferase 3, putative  28.83 
 
 		 596 aa  48.9  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  32.04 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.24 
 
 		 295 aa  48.9  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.66 
 
 		 312 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.8 
 
 		 312 aa  48.5  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  27.81 
 
 		 240 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.38 
 
 		 296 aa  47.8  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.62 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 312 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 312 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 312 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 312 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.67 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 312 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.18 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.89 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  36.92 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.31 
 
 		 312 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  45.95 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  26.24 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.94 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>