165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3694 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  100 
 
 		 217 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  84.65 
 
 		 215 aa  377  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  73.95 
 
 		 218 aa  332  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  69.48 
 
 		 219 aa  300  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  68.45 
 
 		 218 aa  291  6e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  67.96 
 
 		 218 aa  288  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  67.96 
 
 		 218 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  61.32 
 
 		 219 aa  246  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  65.57 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  64.62 
 
 		 216 aa  245  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  65.57 
 
 		 216 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  63.16 
 
 		 219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  62.74 
 
 		 216 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  62.74 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  58.02 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  56.67 
 
 		 219 aa  231  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  58.77 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  56.73 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  55.71 
 
 		 223 aa  228  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  54.72 
 
 		 216 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  61.43 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  60.48 
 
 		 225 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  54.72 
 
 		 218 aa  205  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  50.73 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  50.24 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  50 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  48.13 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  50.24 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  50.24 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  47.85 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  52.13 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  52.4 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  44.5 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  47.18 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  44.62 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  47.37 
 
 		 219 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  44.53 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  40.52 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  44.44 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  42.96 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  47.41 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  46.72 
 
 		 218 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  45.99 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  46.67 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  45.93 
 
 		 219 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  45.19 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  35.07 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.46 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  29.86 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  33.08 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  33.83 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  29.76 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  29.23 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  27.95 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  56.25 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  30.28 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 		 294 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  28.36 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  24.69 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  25.66 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  27.85 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  28.68 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  28.86 
 
 		 236 aa  48.5  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.26 
 
 		 296 aa  48.5  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  30.36 
 
 		 129 aa  48.1  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  29.09 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  35.57 
 
 		 321 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  25.69 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  25.69 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.37 
 
 		 328 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.41 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  25.69 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  25.69 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.17 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1101  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.43 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0205003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.98 
 
 		 297 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.98 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.93 
 
 		 307 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.06 
 
 		 294 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  31.21 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3507  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.81 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340912  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.02 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 		 305 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  35.1 
 
 		 298 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  32.59 
 
 		 285 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.3 
 
 		 308 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.97 
 
 		 278 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  32.98 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.48 
 
 		 506 aa  45.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  33.33 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 		 315 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  30.84 
 
 		 300 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  48 
 
 		 295 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  52 
 
 		 296 aa  45.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  53.19 
 
 		 299 aa  45.4  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02680  nicotinamide N-methyltransferase, putative  25.42 
 
 		 273 aa  45.1  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.06 
 
 		 295 aa  45.1  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  32.05 
 
 		 566 aa  45.1  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>