219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1878 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  100 
 
 
214 aa  421  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  63.64 
 
 
215 aa  238  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  54.07 
 
 
216 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  51.17 
 
 
223 aa  204  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  53.33 
 
 
223 aa  202  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  53.11 
 
 
219 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  48.8 
 
 
218 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  50 
 
 
217 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  48.33 
 
 
218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  49.76 
 
 
219 aa  187  8e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  47.37 
 
 
218 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  47.87 
 
 
215 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  47.44 
 
 
218 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  50.96 
 
 
232 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  48.1 
 
 
220 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  50.23 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  49.54 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  46.45 
 
 
219 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  51.92 
 
 
231 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  48.58 
 
 
218 aa  166  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  50.96 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  47.66 
 
 
219 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  46.67 
 
 
221 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  45.12 
 
 
221 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  51.23 
 
 
217 aa  154  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  47.91 
 
 
216 aa  154  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  48.83 
 
 
216 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  46.73 
 
 
220 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  44.98 
 
 
214 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  46.19 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  44.6 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  45.5 
 
 
222 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  45.02 
 
 
222 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  44.39 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  44.39 
 
 
226 aa  114  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  46.03 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  41.73 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  43.86 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  37.95 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  48 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  49.55 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  48.04 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  47.06 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  48.04 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  44 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  48.04 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  33.12 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  28.38 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  29.81 
 
 
237 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  30 
 
 
227 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  32.58 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  30.86 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  32.19 
 
 
231 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.48 
 
 
300 aa  58.9  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 
233 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  29.35 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 
294 aa  55.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  35 
 
 
216 aa  55.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  25.68 
 
 
221 aa  55.5  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.52 
 
 
299 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  35.35 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  47.27 
 
 
338 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.48 
 
 
311 aa  53.9  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  27.03 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  27.03 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  27.03 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  27.03 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  39 
 
 
295 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  30.83 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  31.21 
 
 
236 aa  52.4  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  25.9 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.1 
 
 
293 aa  52.4  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  24.18 
 
 
300 aa  52  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 
294 aa  51.6  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.61 
 
 
295 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.61 
 
 
295 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.89 
 
 
293 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.89 
 
 
293 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.89 
 
 
306 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.08 
 
 
295 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.08 
 
 
295 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  29.79 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  53.06 
 
 
295 aa  48.9  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  37 
 
 
394 aa  48.5  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.02 
 
 
293 aa  48.5  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
307 aa  48.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.85 
 
 
305 aa  48.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  25.95 
 
 
210 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  30.77 
 
 
246 aa  48.1  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.79 
 
 
286 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.67 
 
 
296 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.99 
 
 
296 aa  47.8  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.35 
 
 
293 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.02 
 
 
297 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  28.57 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  36.27 
 
 
292 aa  47.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  45.61 
 
 
198 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.43 
 
 
278 aa  47  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  28.39 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>