139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1764 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  61.61 
 
 		 227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  58.48 
 
 		 237 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  54.74 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  49.53 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  44.13 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  43.04 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  32.04 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  33.77 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  33.97 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  31.69 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  35.17 
 
 		 236 aa  99.4  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  33.77 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  26.88 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  31.19 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  29.09 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  28.24 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  32.61 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  27.48 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  34.26 
 
 		 129 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  25.73 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  24.73 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  24.73 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  24.73 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  24.73 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  26.04 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  30.83 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  32.06 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  30 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  30.15 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  31.11 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  27.44 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  31.71 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  31.58 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  34.75 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  36.05 
 
 		 338 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  24.84 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  30.08 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  30.56 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  30.08 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  28.1 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  29.63 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46702  predicted protein  31.95 
 
 		 337 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.761256  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  28.57 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45331  predicted protein  37.1 
 
 		 340 aa  48.9  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0689578  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  28.68 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  25.47 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  27.21 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 		 295 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  27.41 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0194  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.94 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  31.3 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.87 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.87 
 
 		 295 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0373  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.94 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0981448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  27.53 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1435  ribosomal L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  25.61 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  30.34 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  26.92 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.77 
 
 		 295 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.77 
 
 		 293 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.77 
 
 		 306 aa  46.2  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.77 
 
 		 293 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0212  ribosomal L11 methyltransferase  38.46 
 
 		 301 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0793007 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.92 
 
 		 304 aa  46.2  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  32.1 
 
 		 295 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  47.06 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  27.07 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  30.25 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48241  predicted protein  24.11 
 
 		 309 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.360676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.77 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  25.95 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  32.1 
 
 		 296 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  34.69 
 
 		 300 aa  45.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.13 
 
 		 290 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  32.1 
 
 		 296 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.52 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 417 aa  45.4  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  38.57 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.65 
 
 		 295 aa  45.4  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  25.68 
 
 		 247 aa  45.4  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  27.82 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  24.81 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  28.29 
 
 		 222 aa  45.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.86 
 
 		 294 aa  45.1  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  24.31 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  26.47 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  36.49 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  29.12 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  27.69 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  30.47 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>