213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4015 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  84.65 
 
 		 217 aa  377  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  70.42 
 
 		 218 aa  317  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  66.99 
 
 		 218 aa  290  8e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  66.5 
 
 		 218 aa  287  7e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  64.49 
 
 		 219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  66.99 
 
 		 218 aa  282  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  61.79 
 
 		 219 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  63.85 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  62.44 
 
 		 216 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  62.68 
 
 		 219 aa  243  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  62.26 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  62.91 
 
 		 220 aa  241  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  62.91 
 
 		 216 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  57.55 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  59.15 
 
 		 220 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  59.91 
 
 		 231 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  54.76 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  55.5 
 
 		 223 aa  228  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  53.99 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  55.71 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  59.05 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  53.77 
 
 		 218 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  48.78 
 
 		 221 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  48.78 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  49.53 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  47.87 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  49.28 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  46.89 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  53.37 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  53.37 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  47.8 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  47.15 
 
 		 221 aa  144  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  45.77 
 
 		 226 aa  141  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  43.78 
 
 		 226 aa  131  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  45.26 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  43.95 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  43.14 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  43.14 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  43.79 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  48.15 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  44.44 
 
 		 219 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  42.48 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  40 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  41.83 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  39.44 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  36.47 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  35.07 
 
 		 338 aa  67  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  33.83 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  32.33 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.18 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.82 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  31.54 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  36 
 
 		 299 aa  53.9  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  30.6 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.87 
 
 		 308 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  28.46 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.46 
 
 		 506 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  52.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  31.79 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  26.71 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.13 
 
 		 307 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174777  unclonable  0.000000000413669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1101  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.29 
 
 		 298 aa  52  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0205003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  41.94 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.87 
 
 		 298 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  28.57 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  32.17 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  26.49 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.87 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.98 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  49.02 
 
 		 311 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.38 
 
 		 307 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  35.29 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  52 
 
 		 294 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  27.94 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 297 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.28 
 
 		 308 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.94 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.17 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  31.3 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.17 
 
 		 298 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  27.21 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  48.21 
 
 		 299 aa  49.7  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  32.7 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.02 
 
 		 295 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2003  ribosomal protein L11 methyltransferase  39 
 
 		 293 aa  49.3  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.221022  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.27 
 
 		 294 aa  49.3  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.47 
 
 		 278 aa  48.9  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  25.47 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.62 
 
 		 296 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.06 
 
 		 293 aa  48.5  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05251  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.45 
 
 		 301 aa  48.5  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  25.34 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 300 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>