213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2248 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  98.58 
 
 
216 aa  411  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  93.46 
 
 
216 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  72.81 
 
 
232 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  73.02 
 
 
219 aa  284  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  72.64 
 
 
216 aa  280  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  65.57 
 
 
217 aa  261  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  62.91 
 
 
215 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  60.55 
 
 
218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  60.85 
 
 
218 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  66.35 
 
 
219 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  60.09 
 
 
218 aa  249  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  58.26 
 
 
218 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  61.32 
 
 
232 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  59.35 
 
 
220 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  58.02 
 
 
219 aa  236  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  55.2 
 
 
223 aa  234  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  60.09 
 
 
219 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  59.91 
 
 
225 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  58.94 
 
 
223 aa  228  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  63.21 
 
 
231 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  58.22 
 
 
218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  52.13 
 
 
216 aa  197  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  49.51 
 
 
221 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  49.03 
 
 
221 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  52.63 
 
 
222 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  48.58 
 
 
214 aa  161  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  50.72 
 
 
217 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  49.51 
 
 
221 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  51.67 
 
 
222 aa  158  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  46.86 
 
 
215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  46.73 
 
 
214 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  47.42 
 
 
221 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  44.33 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  41.44 
 
 
226 aa  114  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  45.92 
 
 
219 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  41.51 
 
 
217 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  39.16 
 
 
218 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  38.99 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  43.17 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  43.88 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  45.31 
 
 
219 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  39.29 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  43.97 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  41.84 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  42.55 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  34.59 
 
 
260 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  43.68 
 
 
338 aa  62.4  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  43.94 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  34 
 
 
216 aa  61.6  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0608  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.94 
 
 
294 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217984  hitchhiker  0.0000000198415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  50.75 
 
 
578 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.33 
 
 
316 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.15 
 
 
300 aa  55.5  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.13 
 
 
315 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
295 aa  55.1  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  48.33 
 
 
318 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
295 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  29.32 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.96 
 
 
312 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.24 
 
 
294 aa  52.8  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.31 
 
 
307 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  32.09 
 
 
235 aa  52.4  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.15 
 
 
295 aa  52.4  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  37.14 
 
 
231 aa  52  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.08 
 
 
295 aa  52  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  31.82 
 
 
239 aa  51.6  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.1 
 
 
308 aa  51.6  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  55.1 
 
 
299 aa  51.6  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.1 
 
 
308 aa  51.6  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.32 
 
 
293 aa  51.6  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.02 
 
 
293 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  41.11 
 
 
394 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  26.96 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.45 
 
 
306 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.98 
 
 
294 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  36.54 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  35.71 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.11 
 
 
296 aa  50.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  30.97 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.62 
 
 
305 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.55 
 
 
293 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.8 
 
 
295 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 
293 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  28.36 
 
 
300 aa  49.3  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 
293 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  27.82 
 
 
227 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  34.65 
 
 
214 aa  48.5  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.96 
 
 
306 aa  48.5  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.37 
 
 
293 aa  48.5  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.59 
 
 
295 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.59 
 
 
295 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.37 
 
 
293 aa  48.5  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.8 
 
 
306 aa  48.5  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  30.56 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.37 
 
 
312 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  27.61 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.59 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  30.71 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  43.48 
 
 
292 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>