73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2589 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  57.67 
 
 
220 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  50.85 
 
 
237 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  44.24 
 
 
219 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  44.65 
 
 
219 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  44.65 
 
 
219 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  44.65 
 
 
219 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  44.65 
 
 
219 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  45.79 
 
 
217 aa  192  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  42.18 
 
 
221 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  39.09 
 
 
230 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  38.68 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  49.57 
 
 
129 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  32.05 
 
 
210 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  27.32 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  27.22 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  27.01 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  31.54 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  28.46 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  36.52 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  25.58 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  29.77 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  28.46 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  30 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  28.16 
 
 
231 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  27.71 
 
 
240 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  33.91 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  33.91 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  25 
 
 
232 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  29.25 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  27.81 
 
 
237 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  26.74 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  26.25 
 
 
264 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  29.01 
 
 
214 aa  55.5  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  30.25 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
278 aa  45.8  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  34.78 
 
 
220 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  25 
 
 
243 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase, putative  30.23 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107993  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  36.25 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.87 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0736  putative protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  29.46 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.75 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2569  putative protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  29.46 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.78 
 
 
313 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  31.3 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.45 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3063  putative protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  29.46 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3124  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  29.46 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2173  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase, putative  29.46 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3099  putative protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  29.46 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.750627  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2044  putative protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  29.46 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12451  hypothetical protein  26.06 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.741785 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41150  predicted protein  28.12 
 
 
347 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41615  predicted protein  24.41 
 
 
386 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  33.04 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1135  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.93 
 
 
281 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.47 
 
 
278 aa  43.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.337848  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.93 
 
 
281 aa  42.7  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.269015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.83 
 
 
251 aa  42.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0604  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.93 
 
 
282 aa  42.4  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
239 aa  42.7  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.25 
 
 
233 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
284 aa  42.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  33.96 
 
 
414 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  24.03 
 
 
286 aa  42  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  28.03 
 
 
300 aa  42  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  22.22 
 
 
244 aa  42  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  31.69 
 
 
258 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.24 
 
 
243 aa  42  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  27.83 
 
 
218 aa  42  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>