52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46702 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_46702  predicted protein  100 
 
 
337 aa  685    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.761256  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  36.15 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  37.84 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  41.28 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  33.55 
 
 
218 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  38.53 
 
 
229 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  36.94 
 
 
236 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  33.09 
 
 
223 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  31.43 
 
 
232 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  31.53 
 
 
233 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  31.58 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  30.1 
 
 
260 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  31.94 
 
 
216 aa  56.6  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  30.72 
 
 
227 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
218 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45331  predicted protein  46.03 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0689578  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  30.72 
 
 
220 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  30 
 
 
218 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  35.1 
 
 
200 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  33.1 
 
 
216 aa  53.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  28.06 
 
 
215 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  26.42 
 
 
244 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  29.33 
 
 
218 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  33.04 
 
 
235 aa  50.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  29.5 
 
 
217 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  31.91 
 
 
218 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  31.47 
 
 
232 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  26.74 
 
 
221 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  29.66 
 
 
230 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40967  predicted protein  26.4 
 
 
458 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  28.48 
 
 
223 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35002  predicted protein  42.11 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  30.43 
 
 
231 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  30.77 
 
 
218 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  41.94 
 
 
210 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  30.64 
 
 
221 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  27.22 
 
 
217 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.82 
 
 
324 aa  46.2  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  37.93 
 
 
338 aa  46.2  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07290  conserved hypothetical protein  31.97 
 
 
250 aa  46.2  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  30.81 
 
 
221 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1451  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.279923  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44043  predicted protein  34.67 
 
 
348 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.198797  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15391  ribosomal protein L11 methyltransferase  33 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  31.29 
 
 
219 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02680  nicotinamide N-methyltransferase, putative  42 
 
 
273 aa  43.5  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  31.82 
 
 
217 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.669539 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10134  glucose-inducible SAM-dependent methyltransferase Rrg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16310)  34.85 
 
 
354 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  26.9 
 
 
249 aa  43.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41615  predicted protein  31.07 
 
 
386 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  28.03 
 
 
225 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>