18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40967 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_40967  predicted protein  100 
 
 
458 aa  944    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  32.73 
 
 
215 aa  63.5  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46371  predicted protein  28.4 
 
 
460 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  29.27 
 
 
233 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  28.92 
 
 
239 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92615  predicted protein  52.27 
 
 
321 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0038468  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  25.68 
 
 
235 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16816  predicted protein  45.16 
 
 
669 aa  50.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000655212 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  34.31 
 
 
264 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  26.52 
 
 
231 aa  47.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  29.55 
 
 
240 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44043  predicted protein  35.48 
 
 
348 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.198797  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45331  predicted protein  25.62 
 
 
340 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0689578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  24.65 
 
 
244 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  26.28 
 
 
210 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  37.29 
 
 
217 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  33.9 
 
 
218 aa  43.9  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  25.75 
 
 
236 aa  43.1  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>