52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6684 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6684  putative methyltransferase  100 
 
 		 256 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0405  FkbM family methyltransferase  32.04 
 
 		 237 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0658878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0864  methyltransferase FkbM family  32.49 
 
 		 282 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2760  methyltransferase FkbM family  28.11 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.00553627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3549  methyltransferase FkbM family  29.87 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.169711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1846  FkbM family methyltransferase  27.31 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000367724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4271  methyltransferase FkbM family  30.95 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4250  methyltransferase FkbM  29.14 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3605  methyltransferase FkbM family  27.04 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4789  methyltransferase FkbM family  26.8 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197254 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  26.22 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1174  FkbM family methyltransferase  28.09 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.830745  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  30.95 
 
 		 619 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  29.83 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  23.18 
 
 		 3811 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  28.65 
 
 		 274 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  33.87 
 
 		 283 aa  52.8  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  28.57 
 
 		 294 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  30.94 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  30.54 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2576  methyltransferase FkbM  33.33 
 
 		 323 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198474  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  31.93 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2059  methyltransferase FkbM family  27.52 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  27.12 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1884  methyltransferase FkbM  32.64 
 
 		 321 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2217  methyltransferase FkbM  36 
 
 		 321 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  31.3 
 
 		 313 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  31.3 
 
 		 326 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  32.39 
 
 		 252 aa  48.5  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  30.23 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  28.03 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  28.3 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4554  FkbM family methyltransferase  28.71 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.02089  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  28.21 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  25.48 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  28.86 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  25 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  25.68 
 
 		 921 aa  45.4  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5961  methyltransferase FkbM family  25.4 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0180421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2290  methyltransferase FkbM family  28.36 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  25.76 
 
 		 2125 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  20.74 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2373  methyltransferase FkbM family  26.15 
 
 		 366 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0101625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4283  methyltransferase, FkbM family protein  25.78 
 
 		 392 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  28.57 
 
 		 374 aa  42.7  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  27.61 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  31.88 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  24.85 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  28.68 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0061  FkbM family methyltransferase  23.53 
 
 		 259 aa  42.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  26.09 
 
 		 792 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2844  methyltransferase FkbM  29.41 
 
 		 312 aa  42  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>