45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3291 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3291  methyltransferase FkbM family  100 
 
 
264 aa  547  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  21.83 
 
 
2125 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  25.74 
 
 
294 aa  58.9  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1183  methyltransferase FkbM family  26.01 
 
 
861 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  26.36 
 
 
7122 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  25.54 
 
 
256 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  25.79 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0435  FkbM family methyltransferase  28.85 
 
 
657 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  25.36 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1846  FkbM family methyltransferase  24.71 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000367724  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  27.22 
 
 
256 aa  48.9  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  25.67 
 
 
235 aa  48.9  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3138  methyltransferase FkbM  24.4 
 
 
657 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3035  methyltransferase FkbM  26.4 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5229  FkbM family methyltransferase  24.4 
 
 
657 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102005  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  26.28 
 
 
657 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1590  methyltransferase FkbM  26.7 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.646237  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0643  methyltransferase FkbM family  33.68 
 
 
212 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  21.83 
 
 
3811 aa  47  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4271  methyltransferase FkbM family  25.13 
 
 
268 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0405  FkbM family methyltransferase  25.83 
 
 
237 aa  46.6  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0658878  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  43.86 
 
 
630 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3605  methyltransferase FkbM family  24.08 
 
 
308 aa  45.8  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  23.71 
 
 
2419 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  22.03 
 
 
921 aa  45.4  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0484  FkbM family methyltransferase  22.84 
 
 
707 aa  45.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2886  hypothetical protein  47.5 
 
 
258 aa  45.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.86298  hitchhiker  0.00766026 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1277  hypothetical protein  31.2 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.668612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  22.82 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3281  methyltransferase  26.34 
 
 
451 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  26.01 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  21.55 
 
 
277 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3578  methyltransferase  26.34 
 
 
446 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550916  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  42.11 
 
 
630 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3233  SAM-dependent methyltransferase  26.34 
 
 
451 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3318  methyltransferase  26.34 
 
 
451 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3533  putative methyltransferase  26.34 
 
 
446 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000121197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  27.95 
 
 
280 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  24.2 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1491  FkbM family methyltransferase  30.77 
 
 
341 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.20081  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1518  methyltransferase FkbM  26.06 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  27.71 
 
 
306 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  23.21 
 
 
265 aa  42.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  25 
 
 
792 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1453  FkbM family methyltransferase  28.67 
 
 
293 aa  42  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214095  hitchhiker  0.000083365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>