108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0484 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0484  FkbM family methyltransferase  100 
 
 		 707 aa  1459    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1173  methyltransferase FkbM  38.89 
 
 		 255 aa  154  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.764759  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  37.19 
 
 		 250 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1588  methyltransferase, FkbM family protein  25.36 
 
 		 291 aa  110  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  35.48 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  31.87 
 
 		 296 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2382  hypothetical protein  36.72 
 
 		 179 aa  79.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.489391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  24.31 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  37.84 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  31.41 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  31.75 
 
 		 294 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2776  hypothetical protein  25.53 
 
 		 267 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  30.82 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3214  hypothetical protein  25.23 
 
 		 267 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  30.48 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  29.41 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  28.02 
 
 		 792 aa  67.4  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  34.48 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  35.97 
 
 		 265 aa  65.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  33.97 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  30.46 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  32.19 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  34.05 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  32.19 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  30.29 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1688  FkbM family methyltransferase  34.25 
 
 		 288 aa  63.9  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  29.33 
 
 		 281 aa  63.9  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  34.68 
 
 		 321 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1277  hypothetical protein  28.77 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.668612 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  29.65 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  32.75 
 
 		 278 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  31.72 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  25.35 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28419  expressed methyltransferase-like protein  25.82 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  32.47 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  32.14 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1312  methyltransferase FkbM family  31.85 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  32.86 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  33.1 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  26.28 
 
 		 625 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  23.15 
 
 		 266 aa  56.6  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  31.25 
 
 		 288 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  30.46 
 
 		 275 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45058  predicted protein  25.71 
 
 		 404 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  31.21 
 
 		 283 aa  57  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  27.05 
 
 		 921 aa  56.2  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2361  FkbM family methyltransferase  32.39 
 
 		 270 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000541582  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  29.31 
 
 		 326 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  29.31 
 
 		 313 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4304  methyltransferase FkbM family  30.59 
 
 		 352 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  30.64 
 
 		 283 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1194  methyltransferase FkbM family  29.78 
 
 		 1498 aa  55.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.288288 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  27.96 
 
 		 454 aa  54.7  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1399  methyltransferase FkbM family protein  29.87 
 
 		 294 aa  54.7  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  32.39 
 
 		 258 aa  54.7  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  29.86 
 
 		 314 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  29.15 
 
 		 272 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  29.94 
 
 		 283 aa  52  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  30.22 
 
 		 263 aa  52  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  24.86 
 
 		 3811 aa  50.8  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1155  FkbM family methyltransferase  25.71 
 
 		 301 aa  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  28.5 
 
 		 277 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0061  FkbM family methyltransferase  28.5 
 
 		 259 aa  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  26.17 
 
 		 332 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  27.59 
 
 		 280 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  30.99 
 
 		 245 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  30.92 
 
 		 321 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  30.87 
 
 		 279 aa  49.7  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  31.37 
 
 		 738 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1846  FkbM family methyltransferase  25.61 
 
 		 303 aa  48.9  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000367724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  27.89 
 
 		 242 aa  48.9  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07250  hypothetical protein  25.66 
 
 		 284 aa  49.3  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  26.22 
 
 		 262 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2886  methyltransferase FkbM  28.49 
 
 		 285 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  27.65 
 
 		 1673 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3071  amino acid adenylation domain protein  44.23 
 
 		 3291 aa  48.1  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0435  FkbM family methyltransferase  29.12 
 
 		 657 aa  48.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2844  methyltransferase FkbM  27.89 
 
 		 312 aa  47.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2095  methyltransferase FkbM  29.57 
 
 		 242 aa  47.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0618  FkbM family methyltransferase  30.14 
 
 		 232 aa  47.4  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  24.35 
 
 		 306 aa  47  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2217  methyltransferase FkbM  32.45 
 
 		 321 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  27.66 
 
 		 239 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  25.7 
 
 		 365 aa  47  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2951  methyltransferase FkbM family  29.73 
 
 		 829 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3138  methyltransferase FkbM  29.9 
 
 		 657 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5229  FkbM family methyltransferase  29.9 
 
 		 657 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102005  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  25.73 
 
 		 2706 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  29.9 
 
 		 657 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3883  FkbM family methyltransferase  27.32 
 
 		 228 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal  0.0192927 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  29.66 
 
 		 741 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  26.59 
 
 		 235 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3296  methyltransferase FkbM family  31.21 
 
 		 323 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 		 515 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3291  methyltransferase FkbM family  22.84 
 
 		 264 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  28.22 
 
 		 234 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  29.86 
 
 		 739 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  25.14 
 
 		 287 aa  45.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3578  methyltransferase  29.45 
 
 		 446 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3318  methyltransferase  29.45 
 
 		 451 aa  44.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>