More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3820 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 515 aa  1072    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  23.5 
 
 		 351 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 355 aa  89.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 351 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 		 332 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 565 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 347 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  29.26 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2577  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  21.36 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 		 329 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 345 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  23.06 
 
 		 782 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  21.63 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 437 aa  67  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  25.09 
 
 		 778 aa  65.5  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  23.08 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4250  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  22.95 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  24.19 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  22.98 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3862  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 		 613 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.33 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  22 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  20.36 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  23.12 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  24.25 
 
 		 367 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  27.57 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  22.19 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  24.08 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1835  hypothetical protein  29.05 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000690534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3065  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.89 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  32 
 
 		 354 aa  59.7  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  26.45 
 
 		 335 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 		 513 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  21.36 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  24.75 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  21.04 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  26.09 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  30.05 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  29.09 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  23.17 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  25.68 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  22.78 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  23.68 
 
 		 354 aa  57  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 356 aa  57  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 		 410 aa  57  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 434 aa  57  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 574 aa  57  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 358 aa  57  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  22.8 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  22.38 
 
 		 301 aa  57  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  21.93 
 
 		 355 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 		 333 aa  56.6  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  22.33 
 
 		 361 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 354 aa  56.6  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 465 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  22.89 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0621  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.8 
 
 		 327 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239747  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 358 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  20 
 
 		 873 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28 
 
 		 330 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  22.46 
 
 		 369 aa  54.7  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  23.78 
 
 		 326 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  22.77 
 
 		 480 aa  54.7  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  22.05 
 
 		 384 aa  54.3  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  24.15 
 
 		 311 aa  54.3  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  24.53 
 
 		 367 aa  53.9  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0920  radical SAM domain protein  22.94 
 
 		 299 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.65 
 
 		 326 aa  53.9  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  20.43 
 
 		 342 aa  53.5  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 373 aa  53.9  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>