113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1954 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
272 aa  537  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  40.11 
 
 
234 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0254  methyltransferase FkbM  34 
 
 
277 aa  122  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  36.48 
 
 
235 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4953  methyltransferase FkbM family  29.62 
 
 
276 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  37.37 
 
 
259 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  34.89 
 
 
239 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5298  FkbM family methyltransferase  35.92 
 
 
261 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  31.63 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  33.51 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  32.53 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  32.61 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  27.01 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  27.04 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  30.05 
 
 
411 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0310  methyltransferase FkbM  33.1 
 
 
244 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  29.09 
 
 
296 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  34.63 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0263  methyltransferase FkbM family  37.24 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  28.43 
 
 
351 aa  59.7  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2236  methyltransferase FkbM  31.21 
 
 
274 aa  59.3  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  30 
 
 
277 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0756  SAM-dependent methyltransferase  22.6 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  31.45 
 
 
321 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  28.08 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  31.71 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  30.6 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  36.6 
 
 
454 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  29.88 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1194  methyltransferase FkbM family  33.73 
 
 
1498 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.288288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  33.33 
 
 
288 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  32.89 
 
 
296 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  33.7 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  28.95 
 
 
239 aa  56.6  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  34.31 
 
 
274 aa  56.2  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  26.7 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2886  methyltransferase FkbM  27.6 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  32.89 
 
 
252 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0942  methyltransferase FkbM  31.16 
 
 
287 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1082  methyltransferase FkbM family  29.27 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2645  FkbM family methyltransferase  32.41 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  29.45 
 
 
625 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0959  FkbM family methyltransferase  31.16 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801487  normal  0.774702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2470  FkbM family methyltransferase  35.17 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036877  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1869  methyltransferase FkbM family  27.95 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2215  methyltransferase, FkbM family  27.95 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1325  methyltransferase FkbM family  27.33 
 
 
239 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal  0.311227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4064  methyltransferase FkbM  32.37 
 
 
250 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  31.37 
 
 
255 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0484  FkbM family methyltransferase  29.15 
 
 
707 aa  52.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5570  methyltransferase FkbM family  32.14 
 
 
248 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0320  methyltransferase FkbM family  30.87 
 
 
265 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1299  methyltransferase FkbM  31.32 
 
 
285 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.71332  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2750  methyltransferase FkbM  31.61 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1251  methyltransferase FkbM family  31.54 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  27.52 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0395  methyltransferase FkbM family  26.88 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0386  methyltransferase FkbM family  26.88 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3029  dimethyladenosine transferase  30.34 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  30.12 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  28.66 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  28.38 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  31.98 
 
 
277 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  29.15 
 
 
279 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  26.5 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  30.93 
 
 
921 aa  49.3  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0021  protein of unknown function Met10  34.88 
 
 
328 aa  49.3  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  25.26 
 
 
281 aa  48.9  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  26.23 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  30.64 
 
 
297 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3813  methyltransferase FkbM  30.89 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.931416  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  30.48 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  25.76 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14511  SAM-dependent methyltransferase  25.76 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.559742  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28419  expressed methyltransferase-like protein  25.64 
 
 
375 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  28.31 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  28.19 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1518  methyltransferase FkbM  31.61 
 
 
237 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4451  methyltransferase FkbM family  30.65 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0344893  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1155  FkbM family methyltransferase  27.8 
 
 
301 aa  47  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2360  methyltransferase FkbM  25.15 
 
 
260 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0204457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2844  methyltransferase FkbM  28.1 
 
 
312 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14081  hypothetical protein  29.56 
 
 
274 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00860845  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  26.39 
 
 
386 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  26.39 
 
 
386 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3028  methyltransferase FkbM  28.93 
 
 
260 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0697  FkbM family methyltransferase  28.36 
 
 
217 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286744  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2582  Ata11 protein  29.09 
 
 
255 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0553282  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  34.48 
 
 
265 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  27.61 
 
 
279 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6633  FkbM family methyltransferase  35.06 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00015631  hitchhiker  0.000119437 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1793  methyltransferase FkbM  26.97 
 
 
283 aa  45.8  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628642  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  30.41 
 
 
294 aa  45.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0618  hypothetical protein  26.2 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1277  hypothetical protein  29.24 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.668612 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12019  methyltransferase  53.33 
 
 
179 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0648  FkbM family methyltransferase  27.66 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.716259  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  28.66 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2760  methyltransferase FkbM family  22.35 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.00553627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  28.11 
 
 
657 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>