30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3813 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3813  methyltransferase FkbM  100 
 
 		 310 aa  627  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.931416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4451  methyltransferase FkbM family  76.45 
 
 		 306 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0344893  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2342  FkbM family methyltransferase  26.87 
 
 		 681 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  30 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  33.09 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  31.25 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  30 
 
 		 256 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  28.03 
 
 		 274 aa  50.1  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  28.87 
 
 		 239 aa  49.7  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  30.89 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0273  methyltransferase FkbM family  29.46 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  30.41 
 
 		 2706 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  32.77 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45058  predicted protein  29.58 
 
 		 404 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  27.41 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  31.85 
 
 		 259 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  33.88 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  28.81 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  30.61 
 
 		 921 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  25.6 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2361  FkbM family methyltransferase  29.92 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000541582  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  28.69 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4789  methyltransferase FkbM family  20.9 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  27.91 
 
 		 234 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  28.67 
 
 		 625 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7105  methyltransferase FkbM family  27.74 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  30.47 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3000  FkbM family methyltransferase  28.42 
 
 		 288 aa  42.7  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.22275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6324  methyltransferase FkbM family  27.69 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3035  methyltransferase FkbM  26.13 
 
 		 235 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>