68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0263 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0263  methyltransferase FkbM family  100 
 
 		 261 aa  522  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0310  methyltransferase FkbM  61.25 
 
 		 244 aa  295  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2645  FkbM family methyltransferase  51.64 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5570  methyltransferase FkbM family  53.47 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2470  FkbM family methyltransferase  52.87 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2056  FkbM family methyltransferase  53.06 
 
 		 256 aa  208  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222179 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1082  methyltransferase FkbM family  41.27 
 
 		 262 aa  171  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0320  methyltransferase FkbM family  43.28 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1251  methyltransferase FkbM family  44 
 
 		 265 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0697  FkbM family methyltransferase  36.19 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286744  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1325  methyltransferase FkbM family  33.63 
 
 		 239 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal  0.311227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  37.24 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  30.46 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2582  Ata11 protein  28.57 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0553282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  30.18 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  29.41 
 
 		 625 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  29.63 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1688  FkbM family methyltransferase  46.88 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  25.52 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  28.4 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  30.63 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0234  hypothetical protein  33.8 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160183  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  31.08 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2886  methyltransferase FkbM  23.4 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14511  SAM-dependent methyltransferase  21.51 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.559742  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  33.53 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  30.34 
 
 		 321 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  27.46 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1299  methyltransferase FkbM  33.33 
 
 		 285 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.71332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  29.83 
 
 		 277 aa  48.9  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  33.33 
 
 		 294 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  29.57 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  33.1 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  25.64 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  34.53 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  26.88 
 
 		 326 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  26.32 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  28.14 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  26.88 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  25.83 
 
 		 386 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  25.83 
 
 		 386 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4451  methyltransferase FkbM family  30.43 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0344893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2511  methyltransferase FkbM  31.17 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0324  FkbM family methyltransferase  27.61 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256046  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  26.72 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  27.41 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  32.19 
 
 		 454 aa  45.8  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2059  methyltransferase FkbM family  24.73 
 
 		 318 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  27.85 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  30.72 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0527  FkbM family methyltransferase  28.67 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  26.54 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5384  methyltransferase FkbM family  22.1 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  24.84 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  28.87 
 
 		 374 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  27.61 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  36.05 
 
 		 792 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  25 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  28.86 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0254  methyltransferase FkbM  34.35 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  26.25 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  30.46 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0618  FkbM family methyltransferase  30.94 
 
 		 232 aa  42.7  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  26.57 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  32.39 
 
 		 1644 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  28.69 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  32.39 
 
 		 1644 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3813  methyltransferase FkbM  25.96 
 
 		 310 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.931416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>