158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3682 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
279 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  36.44 
 
 
278 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  34.17 
 
 
411 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  32.64 
 
 
723 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0435  FkbM family methyltransferase  32.49 
 
 
657 aa  99  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3138  methyltransferase FkbM  31.47 
 
 
657 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5229  FkbM family methyltransferase  31.47 
 
 
657 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102005  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  31.47 
 
 
657 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  28.78 
 
 
1673 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6633  FkbM family methyltransferase  29.15 
 
 
272 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00015631  hitchhiker  0.000119437 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1098  FkbM family methyltransferase  31.05 
 
 
264 aa  87  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  29.13 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  29.69 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  27.41 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  30 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0395  methyltransferase FkbM family  28.84 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0386  methyltransferase FkbM family  28.84 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  30.32 
 
 
488 aa  80.1  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1251  FkbM family methyltransferase  26.76 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000622553  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  32.43 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4783  methyltransferase FkbM  25.7 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  27.13 
 
 
625 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  29.15 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2582  Ata11 protein  33.69 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0553282  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2215  methyltransferase, FkbM family  29.21 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1869  methyltransferase FkbM family  29.21 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5295  hypothetical protein  30.51 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.090256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  27.49 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  29.05 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  27.96 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  30.89 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0234  hypothetical protein  32.04 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160183  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  30.43 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  29.35 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  28.89 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  30.06 
 
 
258 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  29.61 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  29.94 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  31.86 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1312  methyltransferase FkbM family  32.5 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  27.59 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  31.4 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2360  methyltransferase FkbM  28.16 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0204457 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  28.45 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07250  hypothetical protein  28.04 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  28.65 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  27.89 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  29.1 
 
 
321 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  26.41 
 
 
792 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4304  methyltransferase FkbM family  29.89 
 
 
352 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  30.22 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  28.19 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3374  FkbM family methyltransferase  29.07 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2844  methyltransferase FkbM  31.82 
 
 
312 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  29.17 
 
 
283 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1702  methyltransferase FkbM family  27.36 
 
 
277 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  28.31 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  31.06 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  29.81 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6324  methyltransferase FkbM family  27.06 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1688  FkbM family methyltransferase  26.8 
 
 
288 aa  60.1  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4823  FkbM family methyltransferase  27.98 
 
 
285 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  25.68 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  27.5 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  30.57 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  27.84 
 
 
386 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  27.84 
 
 
386 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  28.49 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  29.56 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  29.55 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  26.74 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  30.5 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  30.5 
 
 
326 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0310  methyltransferase FkbM  30.51 
 
 
244 aa  56.6  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  28.3 
 
 
275 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1299  methyltransferase FkbM  29.1 
 
 
285 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.71332  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  25.52 
 
 
321 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  28 
 
 
348 aa  56.2  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  27.32 
 
 
316 aa  56.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3296  methyltransferase FkbM family  29.66 
 
 
323 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1173  methyltransferase FkbM  27.95 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.764759  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  30 
 
 
374 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2059  methyltransferase FkbM family  24.82 
 
 
318 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1194  methyltransferase FkbM family  31.82 
 
 
1498 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.288288 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  31.76 
 
 
454 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  30.06 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3293  hypothetical protein  25.87 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  28.39 
 
 
661 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1325  methyltransferase FkbM family  29.61 
 
 
239 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal  0.311227 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  29.19 
 
 
239 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2883  methyltransferase FkbM  27.59 
 
 
323 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722379  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  29.03 
 
 
415 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  25.61 
 
 
283 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  26.99 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  30.3 
 
 
262 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  25 
 
 
296 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0320  methyltransferase FkbM family  31.36 
 
 
265 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3281  methyltransferase  26.19 
 
 
451 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136239  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1518  methyltransferase FkbM  29.71 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4064  methyltransferase FkbM  30.34 
 
 
250 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>