39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0527 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0527  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
245 aa  511  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2564  methyltransferase FkbM family  40.68 
 
 
244 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3954  FkbM family methyltransferase  35.55 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415197  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2400  methyltransferase FkbM  28.22 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0672075  normal  0.299288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3883  FkbM family methyltransferase  30.05 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal  0.0192927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0324  FkbM family methyltransferase  25.64 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  23.5 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4876  methyltransferase FkbM family  21.82 
 
 
931 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  26.52 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1518  methyltransferase FkbM  26.26 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3807  hypothetical protein  27.78 
 
 
113 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6325  methyltransferase FkbM family  23.53 
 
 
243 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  26.8 
 
 
321 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4559  hypothetical protein  33.09 
 
 
319 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1277  hypothetical protein  32.33 
 
 
273 aa  52  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.668612 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  25.97 
 
 
235 aa  52  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2217  methyltransferase FkbM  29.71 
 
 
321 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0942  methyltransferase FkbM  24.38 
 
 
287 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0959  FkbM family methyltransferase  24.38 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801487  normal  0.774702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  26.97 
 
 
277 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  26.24 
 
 
262 aa  48.9  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  26.79 
 
 
288 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2115  methyltransferase FkbM family  31.07 
 
 
333 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11547  hypothetical protein  21.63 
 
 
243 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  26.74 
 
 
294 aa  45.4  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  27.08 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  25.81 
 
 
488 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  26.83 
 
 
295 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2114  methyltransferase FkbM family  25 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0263  methyltransferase FkbM family  28.67 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12970  hypothetical protein  21.36 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  23.84 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14511  SAM-dependent methyltransferase  25.57 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.559742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0234  hypothetical protein  29.06 
 
 
275 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160183  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  25.17 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0254  methyltransferase FkbM  24.79 
 
 
277 aa  42.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2290  methyltransferase FkbM family  25.38 
 
 
266 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  28.03 
 
 
261 aa  42  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  23.7 
 
 
257 aa  42  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>