26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2564 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2564  methyltransferase FkbM family  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0527  FkbM family methyltransferase  40.68 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3954  FkbM family methyltransferase  42.99 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415197  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  29.67 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0324  FkbM family methyltransferase  27.84 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256046  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2400  methyltransferase FkbM  29.65 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0672075  normal  0.299288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3883  FkbM family methyltransferase  24.78 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal  0.0192927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3807  hypothetical protein  38.03 
 
 		 113 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6325  methyltransferase FkbM family  27.4 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0942  methyltransferase FkbM  27.27 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0959  FkbM family methyltransferase  27.27 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801487  normal  0.774702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  27.32 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4876  methyltransferase FkbM family  26.89 
 
 		 931 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541495  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14511  SAM-dependent methyltransferase  22.76 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.559742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1518  methyltransferase FkbM  27.09 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  27.07 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4559  hypothetical protein  26.92 
 
 		 319 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3549  methyltransferase FkbM family  28.49 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.169711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2095  methyltransferase FkbM  31.67 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  23.12 
 
 		 321 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  28.67 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2290  methyltransferase FkbM family  28.08 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2114  methyltransferase FkbM family  25 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  33.33 
 
 		 250 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0044  methyltransferase FkbM family  23.85 
 
 		 278 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  35.85 
 
 		 297 aa  41.6  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>