39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0759 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  100 
 
 		 444 aa  902    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  40.26 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  44.54 
 
 		 320 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1160  methyltransferase FkbM family  41.01 
 
 		 879 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.080922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  38.9 
 
 		 459 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1632  FkbM family methyltransferase  39.58 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1328  methyltransferase FkbM family protein  51.02 
 
 		 785 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2577  methyltransferase FkbM family  52.34 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2964  methyltransferase, FkbM family domain protein  52.34 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1730  methyltransferase FkbM  34.57 
 
 		 342 aa  202  8e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  37.37 
 
 		 1644 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  37.37 
 
 		 1644 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  46.36 
 
 		 243 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  43.35 
 
 		 271 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  46.88 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0748  FkbM family methyltransferase  44.89 
 
 		 447 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  38.87 
 
 		 265 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  41.41 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  30.54 
 
 		 219 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  26.24 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  33.72 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  29.03 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2368  hypothetical protein  42.86 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3279  hypothetical protein  30.36 
 
 		 190 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4762  FkbM family methyltransferase  29.86 
 
 		 243 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2698  methyltransferase FkbM family  28.16 
 
 		 579 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917993 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11547  hypothetical protein  34.13 
 
 		 243 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  28.57 
 
 		 294 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1267  methyltransferase FkbM family  24.73 
 
 		 255 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  23.17 
 
 		 569 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  30.56 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3071  amino acid adenylation domain protein  31.36 
 
 		 3291 aa  47  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2335  methyltransferase FkbM  24.52 
 
 		 233 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45808  predicted protein  26.63 
 
 		 784 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558065  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 		 1106 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1043  methyltransferase FkbM  25.14 
 
 		 234 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00514259 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 442 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  30.99 
 
 		 268 aa  43.9  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 		 1084 aa  43.5  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>