39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2284 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  484  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  44.33 
 
 		 219 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  34.52 
 
 		 314 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  34.39 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  29.1 
 
 		 1644 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.1 
 
 		 1644 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  28.8 
 
 		 409 aa  94.7  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1730  methyltransferase FkbM  29.02 
 
 		 342 aa  93.2  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2964  methyltransferase, FkbM family domain protein  26.7 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2577  methyltransferase FkbM family  26.7 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0748  FkbM family methyltransferase  33.73 
 
 		 447 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  32.35 
 
 		 265 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  31.74 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  26.24 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1160  methyltransferase FkbM family  30.54 
 
 		 879 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.080922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  27.54 
 
 		 459 aa  82.8  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1632  FkbM family methyltransferase  27.67 
 
 		 456 aa  82  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1328  methyltransferase FkbM family protein  28.74 
 
 		 785 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  26.19 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  28.86 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  26.04 
 
 		 477 aa  68.9  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1043  methyltransferase FkbM  29.35 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00514259 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2698  methyltransferase FkbM family  26.24 
 
 		 579 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917993 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  28.75 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  24.64 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45808  predicted protein  25 
 
 		 784 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558065  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13911  hypothetical protein  22.44 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3354  hypothetical protein  26.84 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1207  hypothetical protein  25 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4762  FkbM family methyltransferase  25.76 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  25.3 
 
 		 228 aa  49.3  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50607  predicted protein  23.28 
 
 		 351 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1497  hypothetical protein  22.28 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0111137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50348  predicted protein  24.7 
 
 		 317 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00515891  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49826  predicted protein  24.7 
 
 		 317 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  26.83 
 
 		 569 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1399  methyltransferase FkbM family protein  24.74 
 
 		 294 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36060  predicted protein  22.67 
 
 		 322 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2368  hypothetical protein  26.32 
 
 		 249 aa  42  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>