38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2577 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2577  methyltransferase FkbM family  100 
 
 
249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40457  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2964  methyltransferase, FkbM family domain protein  100 
 
 
249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1160  methyltransferase FkbM family  65.13 
 
 
879 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.080922  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1328  methyltransferase FkbM family protein  59.13 
 
 
785 aa  279  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  56.02 
 
 
320 aa  276  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  56.85 
 
 
477 aa  268  7e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  52.34 
 
 
444 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  51.34 
 
 
459 aa  240  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1632  FkbM family methyltransferase  51.34 
 
 
456 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973104  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1730  methyltransferase FkbM  43.97 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  46.26 
 
 
271 aa  208  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  48 
 
 
1644 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  48 
 
 
1644 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  45.45 
 
 
243 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  41.92 
 
 
409 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  42.48 
 
 
265 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0748  FkbM family methyltransferase  42.48 
 
 
447 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  38.74 
 
 
314 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  30.05 
 
 
219 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  26.7 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  28.57 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  29.65 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1043  methyltransferase FkbM  28.48 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00514259 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2368  hypothetical protein  40.48 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4762  FkbM family methyltransferase  30.99 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175794  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  26.55 
 
 
569 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45808  predicted protein  26.64 
 
 
784 aa  48.5  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0643  methyltransferase FkbM family  34.03 
 
 
212 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  27.86 
 
 
283 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  31.13 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49826  predicted protein  26.51 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50348  predicted protein  26.51 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00515891  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0046  methyltransferase FkbM family  26.44 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0044  methyltransferase FkbM family  26.44 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170743  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07250  hypothetical protein  29.63 
 
 
284 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36060  predicted protein  25 
 
 
322 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2698  methyltransferase FkbM family  25.57 
 
 
579 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  31.25 
 
 
332 aa  42  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>