44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00730 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  100 
 
 		 314 aa  625  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  41.08 
 
 		 1644 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  41.08 
 
 		 1644 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0748  FkbM family methyltransferase  43.01 
 
 		 447 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1730  methyltransferase FkbM  43.3 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1160  methyltransferase FkbM family  44.64 
 
 		 879 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.080922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  45.62 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  37.69 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  36.69 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  42.73 
 
 		 409 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  38.29 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  41.41 
 
 		 444 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  43.3 
 
 		 265 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2964  methyltransferase, FkbM family domain protein  38.74 
 
 		 249 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2577  methyltransferase FkbM family  38.74 
 
 		 249 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1328  methyltransferase FkbM family protein  39.46 
 
 		 785 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1632  FkbM family methyltransferase  41.7 
 
 		 456 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973104  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  41.7 
 
 		 459 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  34.52 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  35.93 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  27.36 
 
 		 254 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  30.45 
 
 		 256 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  27.12 
 
 		 569 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2368  hypothetical protein  45.24 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1043  methyltransferase FkbM  30.19 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00514259 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49826  predicted protein  27.27 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50348  predicted protein  27.27 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00515891  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  25.14 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  27.06 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37903  predicted protein  29 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166915  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13911  hypothetical protein  22.75 
 
 		 264 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2698  methyltransferase FkbM family  28.96 
 
 		 579 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3354  hypothetical protein  23.75 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6312  methyltransferase FkbM family  28.95 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1207  hypothetical protein  24.48 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36060  predicted protein  22.96 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4762  FkbM family methyltransferase  31.29 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  29.55 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2335  methyltransferase FkbM  26.4 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1267  methyltransferase FkbM family  25.53 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1497  hypothetical protein  28.25 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0111137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0046  methyltransferase FkbM family  28.28 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0044  methyltransferase FkbM family  28.28 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  34.33 
 
 		 321 aa  42.7  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>