35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0538 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  100 
 
 
228 aa  471  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1043  methyltransferase FkbM  41.86 
 
 
234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00514259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  41.44 
 
 
569 aa  138  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1207  hypothetical protein  37.11 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13911  hypothetical protein  34.07 
 
 
264 aa  88.6  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  34.16 
 
 
430 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  32.32 
 
 
243 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36060  predicted protein  27.6 
 
 
322 aa  78.2  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1497  hypothetical protein  32.54 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0111137  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50607  predicted protein  27.23 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  31.06 
 
 
271 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3354  hypothetical protein  30.99 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37903  predicted protein  28.86 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166915  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  30.14 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  24.31 
 
 
254 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45808  predicted protein  27.75 
 
 
784 aa  60.1  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558065  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2698  methyltransferase FkbM family  27.64 
 
 
579 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2335  methyltransferase FkbM  28.02 
 
 
233 aa  58.9  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352701  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  27.06 
 
 
314 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49826  predicted protein  26.92 
 
 
317 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50348  predicted protein  26.92 
 
 
317 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00515891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  26.53 
 
 
265 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  28.27 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  25.54 
 
 
320 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  25.3 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0046  methyltransferase FkbM family  23.96 
 
 
278 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0044  methyltransferase FkbM family  23.96 
 
 
278 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170743  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0748  FkbM family methyltransferase  26.06 
 
 
447 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3071  amino acid adenylation domain protein  25.53 
 
 
3291 aa  49.3  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2508  hypothetical protein  51.11 
 
 
134 aa  48.5  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.661879 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41518  predicted protein  32.05 
 
 
163 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  27.44 
 
 
409 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2509  hypothetical protein  48.65 
 
 
66 aa  45.1  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0451354  normal  0.622524 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  26.09 
 
 
477 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_93174  predicted protein  40.68 
 
 
327 aa  42  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0346971  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>