35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1497 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1497  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  490  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0111137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3354  hypothetical protein  38.8 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50348  predicted protein  34.95 
 
 		 317 aa  111  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00515891  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49826  predicted protein  34.95 
 
 		 317 aa  111  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  31.53 
 
 		 430 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13911  hypothetical protein  31.08 
 
 		 264 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37903  predicted protein  33.5 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166915  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36060  predicted protein  31.4 
 
 		 322 aa  96.7  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50607  predicted protein  31.11 
 
 		 351 aa  96.7  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1207  hypothetical protein  36.28 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  32.54 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  24.14 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45808  predicted protein  24.88 
 
 		 784 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1043  methyltransferase FkbM  26.11 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00514259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  27.01 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  31.03 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  27.04 
 
 		 569 aa  58.5  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2698  methyltransferase FkbM family  28.11 
 
 		 579 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917993 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  23.56 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41518  predicted protein  38.89 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  23.33 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  27.85 
 
 		 459 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1632  FkbM family methyltransferase  27.85 
 
 		 456 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973104  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  25.57 
 
 		 409 aa  49.7  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2509  hypothetical protein  43.64 
 
 		 66 aa  49.3  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0451354  normal  0.622524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1328  methyltransferase FkbM family protein  26.4 
 
 		 785 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  22.28 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  37.31 
 
 		 1644 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  37.31 
 
 		 1644 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  28.25 
 
 		 314 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  25.35 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  25.12 
 
 		 444 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1730  methyltransferase FkbM  23.16 
 
 		 342 aa  42  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2577  methyltransferase FkbM family  24.14 
 
 		 249 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2964  methyltransferase, FkbM family domain protein  24.14 
 
 		 249 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>