40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0229 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
320 aa  664    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  58.09 
 
 
477 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1160  methyltransferase FkbM family  48.51 
 
 
879 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.080922  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1328  methyltransferase FkbM family protein  57.2 
 
 
785 aa  292  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  44.54 
 
 
444 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2964  methyltransferase, FkbM family domain protein  56.02 
 
 
249 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2577  methyltransferase FkbM family  56.02 
 
 
249 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40457  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1632  FkbM family methyltransferase  41.62 
 
 
456 aa  256  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973104  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  41.5 
 
 
459 aa  255  7e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1730  methyltransferase FkbM  41.06 
 
 
342 aa  224  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0748  FkbM family methyltransferase  39.93 
 
 
447 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  43.46 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  38.28 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  39.24 
 
 
1644 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  39.24 
 
 
1644 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  43.13 
 
 
243 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  39.3 
 
 
265 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  37.69 
 
 
314 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  30.05 
 
 
219 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  30.43 
 
 
256 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  26.19 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  27.78 
 
 
254 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2368  hypothetical protein  45.12 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50607  predicted protein  28 
 
 
351 aa  57  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  28.85 
 
 
569 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3071  amino acid adenylation domain protein  28.14 
 
 
3291 aa  50.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  25.54 
 
 
228 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45808  predicted protein  26.67 
 
 
784 aa  49.3  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558065  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1267  methyltransferase FkbM family  23.76 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36060  predicted protein  23.47 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50348  predicted protein  28.49 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00515891  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49826  predicted protein  28.49 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35605  predicted protein  29.37 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243363  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  28.21 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  23.16 
 
 
245 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4064  FkbM family methyltransferase  26.58 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345765  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37903  predicted protein  26.75 
 
 
293 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166915  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  30.22 
 
 
268 aa  43.1  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  30.46 
 
 
332 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  30.29 
 
 
321 aa  43.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>