28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50607 on replicon NC_011700
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011700  PHATRDRAFT_50607  predicted protein  100 
 
 
351 aa  725    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36060  predicted protein  50 
 
 
322 aa  329  6e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49826  predicted protein  41.06 
 
 
317 aa  187  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50348  predicted protein  41.06 
 
 
317 aa  187  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00515891  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37903  predicted protein  38.02 
 
 
293 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166915  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1497  hypothetical protein  31.11 
 
 
241 aa  96.7  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0111137  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41518  predicted protein  43.9 
 
 
163 aa  95.5  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13911  hypothetical protein  28.51 
 
 
264 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  32.21 
 
 
430 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3354  hypothetical protein  31.21 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  27.23 
 
 
228 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1207  hypothetical protein  29.26 
 
 
250 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2508  hypothetical protein  30.58 
 
 
134 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.661879 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45808  predicted protein  26.47 
 
 
784 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558065  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  22.95 
 
 
256 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  28 
 
 
320 aa  57  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1043  methyltransferase FkbM  28.83 
 
 
234 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00514259 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  24.06 
 
 
1644 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  24.06 
 
 
1644 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  27.69 
 
 
254 aa  49.7  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2698  methyltransferase FkbM family  27.06 
 
 
579 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  26.35 
 
 
271 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  23.28 
 
 
231 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  26.29 
 
 
243 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  23.2 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  22.03 
 
 
219 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2509  hypothetical protein  35.29 
 
 
66 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0451354  normal  0.622524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  23.98 
 
 
569 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.909062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>