28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45808 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45808  predicted protein  100 
 
 
784 aa  1628    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558065  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35605  predicted protein  72.64 
 
 
251 aa  308  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243363  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49307  predicted protein  76.16 
 
 
1731 aa  259  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.339493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1497  hypothetical protein  24.88 
 
 
241 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0111137  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  30.56 
 
 
254 aa  60.8  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  27.75 
 
 
228 aa  60.1  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13911  hypothetical protein  26.42 
 
 
264 aa  59.3  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50607  predicted protein  26.47 
 
 
351 aa  58.9  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  26.11 
 
 
430 aa  57.4  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36060  predicted protein  24.88 
 
 
322 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  22.4 
 
 
219 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3354  hypothetical protein  22.77 
 
 
238 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  29.41 
 
 
243 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  28.4 
 
 
265 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  27.81 
 
 
271 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37903  predicted protein  23.56 
 
 
293 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2335  methyltransferase FkbM  23.44 
 
 
233 aa  50.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352701  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1207  hypothetical protein  26.45 
 
 
250 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  26.67 
 
 
320 aa  48.9  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1043  methyltransferase FkbM  26.74 
 
 
234 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00514259 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0748  FkbM family methyltransferase  28.33 
 
 
447 aa  48.9  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  25.24 
 
 
256 aa  48.9  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2577  methyltransferase FkbM family  26.64 
 
 
249 aa  48.5  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40457  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  25.99 
 
 
569 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2964  methyltransferase, FkbM family domain protein  26.64 
 
 
249 aa  48.5  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  26.63 
 
 
444 aa  45.8  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  26.63 
 
 
477 aa  44.3  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>