12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41518 on replicon NC_011699
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011699  PHATRDRAFT_41518  predicted protein  100 
 
 
163 aa  340  5e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36060  predicted protein  42.42 
 
 
322 aa  104  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49826  predicted protein  40 
 
 
317 aa  96.7  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50348  predicted protein  40 
 
 
317 aa  96.7  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00515891  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50607  predicted protein  43.9 
 
 
351 aa  95.5  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37903  predicted protein  40.54 
 
 
293 aa  87.4  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166915  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1497  hypothetical protein  38.89 
 
 
241 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0111137  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  35.82 
 
 
430 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3354  hypothetical protein  31.18 
 
 
238 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2508  hypothetical protein  34.48 
 
 
134 aa  48.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.661879 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13911  hypothetical protein  30.88 
 
 
264 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  32.05 
 
 
228 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>