42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0132 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0132  methyltransferase FkbM family  100 
 
 
326 aa  644    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0618  hypothetical protein  32.82 
 
 
264 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  33.14 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  29.48 
 
 
256 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  31.87 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  33.16 
 
 
263 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  32.08 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  30.3 
 
 
283 aa  53.1  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0254  methyltransferase FkbM  22.87 
 
 
277 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07250  hypothetical protein  19.09 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  30.58 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  28.99 
 
 
234 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  25.34 
 
 
277 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2290  methyltransferase FkbM family  24.84 
 
 
266 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1174  FkbM family methyltransferase  28.22 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.830745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  34.46 
 
 
288 aa  49.7  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  29.19 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14081  hypothetical protein  24.43 
 
 
274 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00860845  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28419  expressed methyltransferase-like protein  26.72 
 
 
375 aa  46.2  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0764  methyltransferase FkbM  27.98 
 
 
321 aa  45.8  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1173  methyltransferase FkbM  25.36 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.764759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  26.15 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2750  methyltransferase FkbM  26.42 
 
 
263 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  30.3 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  30.49 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  29.46 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  29.05 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  27.64 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  22.37 
 
 
415 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1277  hypothetical protein  26.03 
 
 
273 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.668612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  26.42 
 
 
266 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0484  FkbM family methyltransferase  29.63 
 
 
707 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  27.37 
 
 
272 aa  43.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  29.59 
 
 
294 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  28.21 
 
 
297 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  35.42 
 
 
261 aa  43.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  37.33 
 
 
305 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  37.33 
 
 
305 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  23.65 
 
 
625 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  23.27 
 
 
386 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  23.27 
 
 
386 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.3 
 
 
328 aa  42.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>