44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5679 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5679  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  901    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72020  hypothetical protein  68.81 
 
 		 433 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6256  hypothetical protein  44.79 
 
 		 497 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6257  putative glycosyltransferase  40.86 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5680  hypothetical protein  50 
 
 		 523 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72010  putative glycosyltransferase  46.51 
 
 		 542 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3861  hypothetical protein  26 
 
 		 583 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 3301 aa  53.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  29.65 
 
 		 377 aa  53.5  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  29.75 
 
 		 1219 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 1261 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 838 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5051  Glycosyltransferase-like protein  29.44 
 
 		 759 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 1241 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 359 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 357 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  20.85 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  26.8 
 
 		 373 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 1233 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 1229 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 1089 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 1241 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 381 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 774 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  20.88 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 		 616 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 624 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 725 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 850 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1996  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 381 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 		 679 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  37.66 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 400 aa  43.1  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  22.37 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 		 376 aa  43.1  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 1915 aa  43.1  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 609 aa  43.1  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>