16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6257 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6257  putative glycosyltransferase  100 
 
 
484 aa  984    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5680  hypothetical protein  41.13 
 
 
523 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72020  hypothetical protein  40.76 
 
 
433 aa  359  7e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5679  hypothetical protein  41.08 
 
 
434 aa  347  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6256  hypothetical protein  41.16 
 
 
497 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72010  putative glycosyltransferase  52.5 
 
 
542 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3861  hypothetical protein  32.06 
 
 
583 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5051  Glycosyltransferase-like protein  33.53 
 
 
759 aa  65.1  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
774 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  25.89 
 
 
1644 aa  50.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  25.89 
 
 
1644 aa  50.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
392 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
725 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
359 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
791 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
1267 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>