More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3082 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3082  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
474 aa  947    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5908  glycosyl transferase group 1  49.64 
 
 
410 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2973  glycosyl transferase, group 1  52.28 
 
 
416 aa  418  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1718  glycosyl transferase group 1  48.72 
 
 
433 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0528  glycosyl transferase, group 1  46.31 
 
 
406 aa  364  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000105595  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0542  glycosyl transferase group 1  46.06 
 
 
406 aa  362  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000128948  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0594  glycosyl transferase, group 1  48.74 
 
 
401 aa  356  5.999999999999999e-97  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1763  glycosyl transferase, group 1  45.73 
 
 
419 aa  345  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.410209  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1359  glycosyl transferase, group 1  48.95 
 
 
402 aa  342  1e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.254886 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0797  glycosyl transferase, group 1  45.61 
 
 
408 aa  330  3e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0419  glycosyl transferase group 1  42.6 
 
 
413 aa  324  2e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.102155  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1592  glycosyl transferase, group 1  42.93 
 
 
414 aa  324  2e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0297  glycosyl transferase group 1  46 
 
 
411 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1821  glycosyl transferase, group 1  40.97 
 
 
403 aa  319  6e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0709671  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0129  glycosyl transferase, group 1  43.38 
 
 
397 aa  318  9e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.730138  hitchhiker  0.000955625 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0451  glycosyl transferase group 1  42.13 
 
 
406 aa  316  7e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.340856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1740  glycosyl transferase group 1  43.78 
 
 
411 aa  316  7e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163685 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2083  glycosyl transferase, group 1  43.78 
 
 
411 aa  316  7e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3832  glycosyl transferase group 1  44.55 
 
 
417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3111  trehalose phosphorylase/synthase  42.54 
 
 
420 aa  310  5e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1812  glycosyl transferase, group 1  43.77 
 
 
407 aa  307  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0100815  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  41.48 
 
 
410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2023  glycosyl transferase, group 1  44.22 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2348  glycosyl transferase, group 1  41.81 
 
 
411 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0363579  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0427  glycosyl transferase group 1  40.05 
 
 
460 aa  279  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.049978  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1550  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
398 aa  229  6e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.267317  hitchhiker  0.0000000000000568319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4094  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
509 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108712  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3637  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
497 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.564588 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05021  trehalose synthase (Ccg-9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12100)  30.59 
 
 
705 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04480  trehalose synthase, putative  27.37 
 
 
734 aa  107  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
377 aa  94.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
375 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
378 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.5 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.83 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.17 
 
 
381 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  25.17 
 
 
381 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  25.17 
 
 
381 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  25.17 
 
 
381 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.17 
 
 
381 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
381 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.83 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.83 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
377 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
384 aa  67  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
389 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
378 aa  67  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
376 aa  67  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.66 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
412 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
360 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  29.49 
 
 
388 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.76 
 
 
935 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
381 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
426 aa  64.7  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0567  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
437 aa  64.3  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.923327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  27.1 
 
 
377 aa  63.9  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
383 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  29.92 
 
 
413 aa  63.9  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  28.32 
 
 
385 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
385 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
420 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  29.52 
 
 
367 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3222  glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 
365 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
378 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
378 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
748 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
416 aa  62  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  26.5 
 
 
379 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  35.42 
 
 
458 aa  60.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
421 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
404 aa  60.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
500 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
402 aa  60.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
376 aa  60.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
400 aa  60.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2760  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
1039 aa  60.1  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
377 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
374 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2581  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
421 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170764  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  25.1 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
1080 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
410 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3895  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
458 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
381 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  25.32 
 
 
416 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 
375 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>