More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0115 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
358 aa  743    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  72.39 
 
 
356 aa  544  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  72.11 
 
 
356 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  72.68 
 
 
356 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  72.39 
 
 
356 aa  546  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  72.11 
 
 
356 aa  541  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  71.83 
 
 
356 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  72.11 
 
 
356 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  42.06 
 
 
361 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  42.06 
 
 
361 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  41.78 
 
 
361 aa  289  6e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  41.23 
 
 
361 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  41.23 
 
 
361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  41.71 
 
 
366 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.23 
 
 
361 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  40.95 
 
 
361 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  41.78 
 
 
361 aa  279  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.83 
 
 
365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
365 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 
359 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 
357 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  36.79 
 
 
309 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  40.54 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  26.76 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  35.27 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  38.04 
 
 
371 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  35.32 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  38.55 
 
 
375 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 
393 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
376 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 
399 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.35 
 
 
396 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
396 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
361 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  35.33 
 
 
348 aa  97.4  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.97 
 
 
392 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.97 
 
 
420 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.97 
 
 
420 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  30.86 
 
 
379 aa  95.9  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.36 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.36 
 
 
420 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.36 
 
 
420 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.36 
 
 
420 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
363 aa  92.8  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  26.18 
 
 
366 aa  91.3  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
376 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  35.93 
 
 
420 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 
374 aa  90.1  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.42 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
373 aa  89  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
375 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  31.07 
 
 
365 aa  87  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  31.07 
 
 
365 aa  87  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.46 
 
 
374 aa  86.7  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  31.07 
 
 
365 aa  86.7  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.99 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
419 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  32.3 
 
 
490 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  32.3 
 
 
490 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  25.2 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  29.44 
 
 
419 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
660 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  37.59 
 
 
386 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.96 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  27.62 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.85 
 
 
496 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
1032 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3918  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  28.9 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0109965 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  30.71 
 
 
496 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  30.71 
 
 
496 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0077  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3937  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  28.9 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  29.13 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3999  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  28.9 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.201364  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3024  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4044  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  28.32 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4106  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  28.32 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248516  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  36.51 
 
 
418 aa  72.8  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2217  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  33.56 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
678 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>