More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3024 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3024  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
356 aa  721    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1370  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  35.25 
 
 
349 aa  209  6e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0077  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
359 aa  206  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3937  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  33.52 
 
 
359 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4106  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  33.52 
 
 
359 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248516  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3918  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  33.52 
 
 
363 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0109965 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3999  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  33.52 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.201364  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4044  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  32.96 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
381 aa  129  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  33.53 
 
 
419 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 
371 aa  101  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.48 
 
 
415 aa  96.3  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 
420 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 
420 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 
392 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 
420 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 
392 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 
420 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 
420 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
419 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
368 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.24 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
374 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
361 aa  87  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
388 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0101  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.58 
 
 
501 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  23.22 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  28.02 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
375 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  23.14 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  22.7 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  26.46 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
370 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
379 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
1032 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 
353 aa  75.9  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
660 aa  73.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
365 aa  72.8  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  23.05 
 
 
416 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.29 
 
 
496 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  29.61 
 
 
440 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  30.54 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  27.83 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
762 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  28.79 
 
 
490 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  25.93 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  28.79 
 
 
490 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  25.65 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  22.58 
 
 
419 aa  66.2  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  25.65 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.18 
 
 
459 aa  65.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
418 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
380 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.18 
 
 
462 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
669 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0187  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
376 aa  65.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
356 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
388 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
412 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
356 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
412 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
412 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>