More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1370 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1370  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  100 
 
 
349 aa  723    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3024  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 
356 aa  209  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4106  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  34.07 
 
 
359 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248516  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3999  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  33.79 
 
 
359 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.201364  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3937  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  33.79 
 
 
359 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3918  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  33.52 
 
 
363 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0109965 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4044  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  33.52 
 
 
359 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0077  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
359 aa  186  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
381 aa  114  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 
358 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.9 
 
 
378 aa  77  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
405 aa  77  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 
373 aa  75.9  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.24 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  21.45 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  24.38 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  27.86 
 
 
490 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  27.86 
 
 
490 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
409 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.5 
 
 
360 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1933  glycosyl transferase, group 1  39.42 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.65 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  22.82 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  24.79 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.14 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.57 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.57 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.37 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  25.91 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  21.99 
 
 
400 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.28 
 
 
420 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.28 
 
 
420 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.28 
 
 
420 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  26.34 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  26.71 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  22.09 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
438 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  32.7 
 
 
405 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  29.41 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
384 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3384  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320283  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.57 
 
 
401 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.37 
 
 
365 aa  64.7  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
405 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  31.76 
 
 
399 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25.73 
 
 
371 aa  63.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
355 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  22.83 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
367 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
399 aa  63.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
384 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  30.87 
 
 
350 aa  63.5  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
399 aa  63.5  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
385 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  27.16 
 
 
405 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  25.45 
 
 
382 aa  63.2  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1200  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
384 aa  63.2  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
361 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 
375 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
350 aa  62.8  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
739 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
346 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
381 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
377 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
363 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  23.57 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3017  glycosyl transferase group 1  35.51 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  22.77 
 
 
343 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  23.59 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  32.87 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 
378 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5027  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
856 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  30.11 
 
 
513 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>