More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8508 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8508  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
309 aa  608  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  0.0306024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  48.03 
 
 
329 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  46.98 
 
 
307 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  39.74 
 
 
312 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  44.63 
 
 
705 aa  195  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  36.55 
 
 
315 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  40.87 
 
 
325 aa  163  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  33.83 
 
 
907 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  34.83 
 
 
884 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
306 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
314 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 
318 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
324 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
324 aa  96.7  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
308 aa  95.9  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
334 aa  92.8  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
312 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
324 aa  92.4  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
306 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  29.04 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
324 aa  90.5  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
306 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 
313 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
312 aa  86.3  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  31.89 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  24.03 
 
 
652 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  23.85 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.37 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
282 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
317 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  20.77 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  26.54 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  20.39 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  26.56 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 
705 aa  72.4  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0786  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460061  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0457  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
247 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3264  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 
248 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  29.28 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  22.1 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
376 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 
489 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 
679 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  23.75 
 
 
624 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  20.38 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.59 
 
 
722 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>