More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0771 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0771  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0457  glycosyl transferase family protein  44.26 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3264  glycosyl transferase family 2  36.51 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0724  glycosyl transferase family protein  41.32 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837164  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0348  glycosyl transferase family 2  36.48 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4141  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1228  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1319  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 		 275 aa  99  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2327  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.08 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2292  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3154  putative glycosyl transferase  36.15 
 
 		 613 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1842  putative glycosyl transferase  36.15 
 
 		 613 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.471452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0933  putative glycosyl transferase  36.15 
 
 		 623 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2763  putative glycosyl transferase  36.15 
 
 		 613 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.618349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3094  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.15 
 
 		 613 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3131  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.15 
 
 		 613 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1479  putative glycosyl transferase  36.15 
 
 		 613 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0405  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0884  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3130  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.63 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3153  putative glycosyl transferase WbiF  27.63 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1979  glycosyl transferase, putative  27.63 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0934  putative glycosyl transferase  27.63 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.164411  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3093  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.63 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  27.11 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 		 318 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 		 334 aa  78.6  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0854  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1480  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  27.55 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2764  putative glycosyl transferase  28.12 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1841  putative glycosyl transferase  28.12 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718732  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3458  glycosyltransferases-like protein  25.93 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0190923  normal  0.0113746 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2632  glycosyltransferases-like  29.03 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1140  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.09 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0736  putative dTDP-rhamnosyl transferase  30.65 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574558  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 		 1435 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3981  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.653687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2507  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 221 aa  72  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 		 336 aa  72  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.53 
 
 		 379 aa  72  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  33.11 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0899  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  27.76 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 326 aa  68.6  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  27.41 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  21.31 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0558  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863042  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.89 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 307 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  26.03 
 
 		 907 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2736  glycosyltransferase-like protein  32.12 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 705 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  27.63 
 
 		 642 aa  66.2  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  27.07 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0786  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460061  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  22.81 
 
 		 652 aa  65.5  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0993  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285177 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3783  putative glycosyl transferase  24.71 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193326  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  32.32 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 1287 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>