201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3458 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3458  glycosyltransferases-like protein  100 
 
 
256 aa  521  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0190923  normal  0.0113746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2327  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.85 
 
 
247 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0457  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
247 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3264  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0348  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  24.26 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0854  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0884  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
281 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0405  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3981  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.653687 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 
301 aa  75.5  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0724  glycosyl transferase family protein  23.05 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0771  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3783  putative glycosyl transferase  26.73 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193326  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4141  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000193377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0899  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2507  glycosyl transferase family protein  23.74 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1319  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2292  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  25.46 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  22.36 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  23.98 
 
 
301 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0736  putative dTDP-rhamnosyl transferase  24.08 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574558  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
289 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
324 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
340 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
294 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
296 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
296 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3130  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.87 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
296 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  21.89 
 
 
324 aa  62.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3153  putative glycosyl transferase WbiF  26.87 
 
 
318 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0993  glycosyl transferase family 2  24.29 
 
 
301 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285177 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1228  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
276 aa  62.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3093  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.87 
 
 
276 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1979  glycosyl transferase, putative  26.73 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0934  putative glycosyl transferase  26.6 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.164411  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2764  putative glycosyl transferase  26.73 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1841  putative glycosyl transferase  26.73 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  24.86 
 
 
305 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
334 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1480  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  23.76 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 
336 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  30 
 
 
301 aa  60.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
275 aa  60.1  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
324 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
334 aa  58.9  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  24.09 
 
 
318 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_002950  PG1140  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.19 
 
 
286 aa  58.2  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  23.16 
 
 
297 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 
290 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
318 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  26.04 
 
 
288 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.71 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  22.99 
 
 
303 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 
318 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1249  glycosyl transferase  24.18 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  24.45 
 
 
310 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2736  glycosyltransferase-like protein  27.27 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1219  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.428258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 
318 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.28 
 
 
379 aa  57  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
310 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  24.09 
 
 
318 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
315 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
308 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
313 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  25.39 
 
 
652 aa  55.5  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2722  glycosyl transferase family protein  22.39 
 
 
278 aa  55.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 
311 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  25.83 
 
 
336 aa  54.7  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
306 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 
329 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
330 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
319 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 
326 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
334 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  23.12 
 
 
325 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2632  glycosyltransferases-like  24.41 
 
 
289 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0558  glycosyl transferase family 2  25.15 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863042  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  22 
 
 
340 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 
311 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
683 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 
324 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>