More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2298 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2298  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 402 aa  776    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200708  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0217  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3576  glycosyl transferase  43.81 
 
 		 410 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 		 748 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  27.24 
 
 		 754 aa  99.8  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 924 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  27.39 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  29.38 
 
 		 236 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 319 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  34.27 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  40.74 
 
 		 300 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 		 753 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1407  putative glycosyl transferase  33.06 
 
 		 243 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 841 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.7 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  28.19 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 623 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1357  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 		 333 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  27.43 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 857 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 		 235 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 		 287 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3588  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.690536  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.56 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3495  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  27.41 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.56 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3118  family 2 glycosyl transferase  29.93 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0725  family 2 glycosyl transferase  28.28 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0538326 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.56 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.56 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.56 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.56 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.56 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.62 
 
 		 957 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  29.69 
 
 		 272 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  26.81 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 		 528 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0203  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.72 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.97495  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  31.89 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  31.89 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  28.8 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  31.89 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 		 1198 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7666  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  35.75 
 
 		 1132 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1700  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  27.13 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 327 aa  57  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 333 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 282 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.04 
 
 		 327 aa  57  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.04 
 
 		 327 aa  57  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.246717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>