More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3576 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3576  glycosyl transferase  100 
 
 		 410 aa  803    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2298  glycosyl transferase family protein  43.81 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200708  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0217  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 748 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  27.34 
 
 		 754 aa  102  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 		 924 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 		 775 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  34.63 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 		 753 aa  73.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 		 841 aa  73.6  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 		 836 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  24.35 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  31.47 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0138  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  31.39 
 
 		 838 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 		 988 aa  68.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 1340 aa  67.8  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  24.54 
 
 		 994 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 996 aa  66.6  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 		 344 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  35.16 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 304 aa  66.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  31 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 717 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 742 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 742 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 		 1035 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 742 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 717 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  26.92 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.76 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  26.92 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 340 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 721 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 670 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.92 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 		 710 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.92 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  31.14 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  25.17 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 1759 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 		 1739 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  21.03 
 
 		 722 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 		 1275 aa  60.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  29.77 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  28.29 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.52 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0203  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.07 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.97495  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 		 236 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 1198 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0838  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.499828 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 290 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.81 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>