240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1298 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1298  glycosyltransferases-like  100 
 
 		 334 aa  665    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2133  putative glycosyltransferase  46.23 
 
 		 329 aa  275  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1286  glycosyltransferases-like  46.39 
 
 		 292 aa  250  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  28.88 
 
 		 907 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0348  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 		 244 aa  69.3  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 		 841 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  29.17 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  24.28 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0993  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  21.43 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  29.45 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  29.36 
 
 		 642 aa  62.8  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  27.76 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  26.06 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  33.15 
 
 		 838 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 		 307 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 		 1340 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.34 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  28.98 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3264  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 		 683 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  24.07 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5047  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 703 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 1267 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 1268 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  27.78 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 836 aa  55.8  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 1267 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 624 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0736  putative dTDP-rhamnosyl transferase  30.04 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0457  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1629  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 		 818 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  23.98 
 
 		 275 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>