115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2133 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2133  putative glycosyltransferase  100 
 
 
329 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1286  glycosyltransferases-like  61.86 
 
 
292 aa  324  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1298  glycosyltransferases-like  46.23 
 
 
334 aa  275  8e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
282 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  28.24 
 
 
907 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  22.94 
 
 
307 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  22.1 
 
 
303 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
319 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
455 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
841 aa  59.3  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3264  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
248 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  20.28 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  26.02 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
311 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
318 aa  56.6  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
318 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  21.19 
 
 
305 aa  56.6  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
327 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
325 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  23.27 
 
 
754 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0348  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 
244 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19972 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
340 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  24.31 
 
 
884 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
306 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  29.93 
 
 
274 aa  52.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
340 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 
361 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
970 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  20.23 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  23.77 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0457  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
247 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  23.01 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  22.31 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  22.98 
 
 
320 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  23.35 
 
 
324 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
624 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
355 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
304 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
314 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
334 aa  49.7  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
297 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
303 aa  49.3  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 
340 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  21.97 
 
 
325 aa  49.3  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.2 
 
 
311 aa  49.3  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
489 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3130  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.94 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3732  glycosyltransferase-like protein  34.95 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  0.0274925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  22.17 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1979  glycosyl transferase, putative  25.94 
 
 
276 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  21.28 
 
 
313 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
314 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
679 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  23.74 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0934  putative glycosyl transferase  25.94 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.164411  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2764  putative glycosyl transferase  25.94 
 
 
266 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1841  putative glycosyl transferase  25.94 
 
 
266 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2894  glycosyl transferase family protein  24.82 
 
 
285 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3093  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.75 
 
 
276 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.65 
 
 
322 aa  46.2  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
307 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0018  glycosyl transferase  30.49 
 
 
300 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  25.73 
 
 
838 aa  45.8  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3153  putative glycosyl transferase WbiF  25.75 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  23.96 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  22.17 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 
312 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  23.98 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  37.89 
 
 
642 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>