85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1286 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1286  glycosyltransferases-like  100 
 
 
292 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2133  putative glycosyltransferase  61.86 
 
 
329 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1298  glycosyltransferases-like  46.39 
 
 
334 aa  255  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0348  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  25.36 
 
 
907 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
303 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3264  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  38.96 
 
 
318 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  48.08 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  21.91 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  46.15 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  37.66 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 
319 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
455 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  36.99 
 
 
334 aa  53.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0736  putative dTDP-rhamnosyl transferase  32.94 
 
 
281 aa  52.8  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574558  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
324 aa  52.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 
361 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0457  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  31.34 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
327 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  22.31 
 
 
308 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0724  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  25.13 
 
 
298 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
312 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
311 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
307 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
304 aa  49.3  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 
346 aa  49.3  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0771  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
252 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 
841 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  21.38 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4141  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000193377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  24.29 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 
314 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  23.22 
 
 
301 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
327 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1077 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 
310 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 
306 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
340 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2894  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
285 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3732  glycosyltransferase-like protein  35.59 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  0.0274925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  30.91 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  28.44 
 
 
754 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  30.91 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  30.91 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
624 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
1340 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 
360 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  23.35 
 
 
321 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  39.66 
 
 
336 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
818 aa  42.7  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  21.46 
 
 
703 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 
333 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
340 aa  42.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 
336 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
822 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3130  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.29 
 
 
276 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 
330 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  24.84 
 
 
1739 aa  42.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
325 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
312 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4004  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
327 aa  42.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>